Pierwsze zakronikowane wpisy na temat Chałup pojawiły się w roku 1920. Wcześniej wieś funkcjonowała w okolicach jako Budziszewo bądź Ceynowa, nazwy te pochodziły od nazwisk mieszkańców miejscowości, do dziś większość rybackich osad na Helu pochwalić się może co najmniej kilkoma osobami o jednym z tych nazwisk. Chałupy powstały na gruzach fortyfikacji władysławowskich zbudowanych w XVII wieku za panowania króla Władysława IV. W XIX wieku wydarzyła się znana z książki "Wiatr od Morza" Stefana Żeromskiego historia zamordowania domniemanej czarownicy Krystyny Ceynowej. Mieszkańcy zauważywszy, iż wdowa nie chodzi do kościoła, a na kominie jej domu zasiadały często czarne wrony, oznaczające zło i nieszczęście zarzucali jej czary, efektem których miała być choroba jednego z mieszkańców. Sprowadzony z niedalekiego Sopotu znachor kazał przeprowadzić bolesne próby, które według niego wskazywały jednoznacznie na posługiwanie się przez wdowę magią. Głodzona Ceynowa przyznając się do winy została zatłuczona na śmierć wiosłami. Znachor oraz jego współpracownicy zostali skazani na kilka lat więzienia przez sąd.
Czas poprowadzenia linii kolejowej z Helu do Władysławowa to kluczowy moment rozkwitu miejsca jako miejscowości turystycznej. W latach 70 miejscowość zaczęła jeszcze dynamiczniej rozwijać się turystycznie. Przyciągały szerokie plaże, które szczególnie upodobali się naturyści i nudyści, którzy szukając ustronnego i naturalnego miejsca, z dala od wczasowego ośrodka Władysławowa zawędrowali pod Chałupy.